L’histoire se passe en même temps que le début de Soul Eater. Sid est encore humain, et Médusa est toujours infirmière.
Tsugumi Harudori est une jeune fille originaire du Japon, choisie pour intégrer la prestigieuse école de Shibusen. Alors qu’elle est un peu inquiète quant à sa rentrée, elle croise Maka, dans les marches qui monte vers l’école. Tout de suite, Tsugumi est décidé à devenir comme celle qu’elle idéalise : belle et forte.
Mais à peine est-elle arrivé qu’un problème se pose déjà : la formation des duos. En effet, Tsugumi est de catégorie « arme », et doit se trouver un manieur avec qui faire équipe…. mais elles sont deux à se concurrencer!
