Black Bird raconte l’histoire de Misao Harada, une lycéenne ordinaire, qui a toujours été capable de voir des créatures surnaturelles appelées yōkai. Bien qu’elle ait appris à les ignorer pour vivre une vie normale, tout change le jour de ses 16 ans lorsqu’elle devient la cible de nombreux yōkai désireux de consommer son sang ou de la prendre pour épouse. Misao découvre alors qu’elle est une Senka, une femme humaine rare dont le sang peut accorder l’immortalité ou des pouvoirs incroyables à celui qui la revendique.
Son destin bascule lorsqu’elle retrouve son ami d’enfance, Kyo Usui, qui s’avère être un tengu, un yōkai puissant et le chef de son clan. Kyo révèle qu’il est amoureux de Misao depuis leur enfance et souhaite l’épouser pour la protéger des autres yōkai. Cependant, son amour est-il vraiment désintéressé, ou cherche-t-il simplement à bénéficier des pouvoirs que lui apporterait leur union ?
Misao se retrouve alors déchirée entre ses sentiments pour Kyo et la crainte des intentions des yōkai qui la poursuivent. Tandis qu’elle s’enfonce dans le monde dangereux des créatures surnaturelles, elle doit décider si elle peut faire confiance à Kyo et accepter son rôle dans ce monde inconnu.
